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可变剪接(Alternative splicing):一个基因的外显子以不同的组合方式剪接形成不同的成熟RNA,由此产生的不同的 mRNA 可能被翻译成不同的蛋白质构体,因此...
rMATS是常用的选择性剪切(alternative splicing)分析软件。目前最新版是rMATS 4.1.2,已经可以通过conda安装,步骤如下:第一步创建小环境r...
1. 介绍 任何语言的包,依赖和环境管理:Python,R,Ruby,Lua,Scala,Java,Javascript,C / C ++,FORTRAN Conda是一个开...
rMATs rMATs运行: 在rMATstest这个文件夹里有官网下载好的2x2测试文件: 用samtools查看bam文件: 可以看到第三列为1,代表1号染色体(这里是1...
作者:马可菠萝审稿:童蒙编辑:angelica 引言 随着Hi-C技术的建立和发展,越来越多的技术可以用于DNA-DNA相互作用的研究,类似的RNA-RNA相互作用检测技术业...
qRT-PCR实验原理 RT-qPCR由普通PCR技术发展而来,它是在传统PCR反应体系中加入荧光化学物质(荧光染料或者荧光探针),根据各自不同的发光机制实时检测PCR退火、...
搜索基因的mRNA序列 选择gene,搜索框中输入基因名称、human/其他物种,然后search注意选择人类的基因,点进去 选择mRNA 向下滑动到mRNA and pro...
感觉100年没有上简书,近2个月忙于毕业论文以及公众号推文,没有时间更文章。终于前几天交了论文呢,可以回来更文了。没错我只是在为我的懒惰寻找接口,今天我们来讲一下桑基图(Sa...
拖延症让我一直疲于整理qiime2的分析过程。而且手上暂时也没有相应的16S数据要分析,所以打算整理整理R的画图脚本。而且总是百度一些画图细节让我“厌倦”了,觉得自己急需整理...
本文选取在R语言中文社区发文较多、较系统的作者整理而成,作者排名不分先后。 陈丹奕: 知乎大神丹奕论道数据分析师自我修养之天龙八步 建模那点事儿——实战篇 7个步骤,带你从零...
可变剪切定义 有些基因的一个mRNA前体通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点)产生不同的mRNA剪接异构体,这一过程称为可变剪接(或选择性剪接, alternative s...
什么是可变剪接? 可变剪接(Alternative Splicing,AS)是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的...