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请问输入的vcf文件是要只要纯和位点吗?还是所有的都可以
phASER 计算等位基因表达等位基因的特定表达(allelespecificexpression,ASE)数据是后续分多分析的基础。利用它可以识别印记基因、研究蛋白截断变异以及用于量化顺式(cis)调...
大佬你好,获得的snp水平的counts怎么转化到gene水平的counts呢?如果进行求和的话父母本相对于参考基因组的snp数量不一致导致一个亲本counts数异常高于另一个亲本该怎么办呢?
GeneiASE —— ASE检验在ASEReadCounter完成位点的覆盖度信息计数统计之后,还需要对位点添加基因ID,随后做二项分布和费舍尔精确检验,这里推荐GENEiase软件。 ASE (等位基因特...