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拟时序（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析，根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况通过拟时分析可以来推断发育过程细胞的分化轨迹...

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其实我一直没用过WGCNA，因为分析网络的方法有很多，但是大家好像都更爱用这个。最近帮人分析的几组数据，他们指名要用WGCNA分析，所以就学习一下。 =======WGCNA...

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我在前面也分享过几篇关于WGCNA的帖子，其实WGCNA本身就是对基因进行了加权共表达，合理分组的结果。 如果对于一个表达量矩阵，本身就至于2个分组，WT和处理，那么简单的差...

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在上篇棉花相关的单细胞帖子我提到过： 文中是这样说的：Guided by the bulk samples of cotyledons (0, 12, 24, 36 and ...

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其实在前面也提到过Pseudotime分析，拟时间序列分析（Pseudotime分析）是通过构建细胞间的变化轨迹来重塑细胞随着时间的变化过程。从具体的分类分析和复杂程度来说，...

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前面一个帖子讲了scissor的原理以及paper中的一些应用实例。几天我们来测试这个工具。 ========安装======== devtools::install_git...

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1、创建自己的NCBI账号 过程，略 2、创建BioProject 1、进入BioProject 2、选择Submission 3、创建new Submission 4、随后...

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单细胞转录组测序数据分析之拟时序分析简介 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/2f318acfc5c4] 定义 拟时序分...

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轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...