两种整合方法详解 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、...
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你可能会问“ Why should I use R?" 1.从上面图中,我们可以看到R是数据科学家招聘广告中最受欢迎的五种语言之一; 2.免费 3.功能广泛:R是一种非常通用...
医学生零基础学生信是先学Python还是先学R语言?[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何学习R语言[https://www...
关于火山图,绘制的教程有很多也有不少专门绘制火山图的包,说到底火山图无非就是散点图的变形,本节来介绍如何通过ggpotl2绘制火山图 安装&加载R包 ctrl+shift+M...
对于非模式生物或者无参考基因组的项目,经常需要进行基因的功能注释,而GO注释是基因功能注释的重要部分。有很多软件能够获得GO注释的信息,例如interproscan、eggn...
前面给大家简单介绍过☞什么是Gene Ontology(GO)[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.co...
一. GO/KEGG (一)富集分析 (二)GOChord、弦图什么的 脱离clusterprofiler包,需要从以上富集结果整理输入文件 (三)进阶富集分析比较与可视化 ...
本文写于观看生信技能树公众号(vx: biotrainee)的七步走纯R代码通过数据挖掘复现一篇实验文章(第1到6步)[https://mp.weixin.qq.com/s/...
参考学习资料:还是小洁老师的TCGA-3.R包TCGA-biolinks下载数据下载安装包 这个包有点大,安装需要点时间其实从知道这个包名,应该就知道怎么学习了,不用赘述 学...
1. 什么是TCGA?TCGA中有哪些数据? TCGA的全称是The Cancer Genome Atlas, 这个项目始于2005年,它旨在使用基因测序和生物信息学编目与癌...
背景介绍 Bioconductor项目的主要优势之一在于使用通用数据基础结构,该数据基础结构可实现跨越R包的相互操作性。 用户应该能够使用来自不同Bioconductor软件...
本文参考Satija Lab的seurat 包,网址https://satijalab.org/seurat 设置Seurat对象 在本教程中,我们将分析10X Genomi...