Y_bc4c

并且我看了chrName.txt文件，发现chrName.txt里面包含了所有的genome.fasta中的序列。
都是18719个。
这正常吗？

Viral-Track： 揭示重症COVID-19病人的感染特征

前言   今年的新冠可谓是来得触不及防，对各个行业多带来了很大的影响。庆幸的是在全国人民一起配合的努力下，国内的疫情被控制的很好，相比于海外来说，简直是天壤之别了。现在想想能...

生信云笔记

2612 9 8

Y_bc4c

我查看了less genomes.fasta内容：随便看了一条病毒序列的名字如下
refseq|NC_029549|2211nt|Emaravirus tritici, complete genome
但是我看了我第一步构建比对索引的结果chrName.txt看了下这个病毒：
refseq|NC_029549|2211nt|Emaravirus
refseq|NC_029550|1441nt|Emaravirus
refseq|NC_029551|1682nt|Emaravirus
refseq|NC_030691|8904nt|Aquatic
refseq|NC_017937|15276nt|Nariva
这个结果正常吗？看着名字都不全。是什么原因啊？
请大神指点🙏

Viral-Track： 揭示重症COVID-19病人的感染特征

前言   今年的新冠可谓是来得触不及防，对各个行业多带来了很大的影响。庆幸的是在全国人民一起配合的努力下，国内的疫情被控制的很好，相比于海外来说，简直是天壤之别了。现在想想能...

生信云笔记

2612 9 8

Y_bc4c

@生信云笔记 您好，请问umi-tools分析时，--expect-cells=200和--set-cell-number这两个参数具体意义是什么？一般一个样本的单细胞数据最后检测到的细胞数应该接近8k甚至1万，这里的参数--expect-cells=200和--set-cell-number=100，这200和100都是什么意思？为啥数字这么小。两个参数是否可以都不设置

Viral-Track： 揭示重症COVID-19病人的感染特征

前言   今年的新冠可谓是来得触不及防，对各个行业多带来了很大的影响。庆幸的是在全国人民一起配合的努力下，国内的疫情被控制的很好，相比于海外来说，简直是天壤之别了。现在想想能...

生信云笔记

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Y_bc4c

您好，看了您在20年发布的Viral-Track： 揭示重症COVID-19病人的感染特征的简书 想请教一个问题 我的样品的部分细胞里插入了病毒序列，预计某些细胞中会检测到病毒。但是最后定量发现检测到病毒的细胞数远比预计要多。判断是存在一定的背景病毒RNA。请问能否用Viral-Track这个方法将背景病毒判断出来从而进行过滤？

Viral-Track： 揭示重症COVID-19病人的感染特征

前言   今年的新冠可谓是来得触不及防，对各个行业多带来了很大的影响。庆幸的是在全国人民一起配合的努力下，国内的疫情被控制的很好，相比于海外来说，简直是天壤之别了。现在想想能...

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