@益民厂老厂长(⊙o⊙)好哇！太感谢了
微生物多样性qiime2分析流程(3) 使用figaro来得到dada2正反向截断参数dada2插件对原始数据paired-end-demux.qza进行质量过滤需要两个参数，trunc-len-f和trunc-len-r。这个想法是通过尽可能多地删除较低质量...
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IP属地：上海
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@acfe39f0bf1a 请问你有解决吗？求方法，之前放弃了用这个😂
微生物多样性qiime2分析流程(3) 使用figaro来得到dada2正反向截断参数
dada2插件对原始数据paired-end-demux.qza进行质量过滤需要两个参数，trunc-len-f和trunc-len-r。这个想法是通过尽可能多地删除较低质量...
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您好！我运行python $PWD/figaro/figaro.py -i /home/u/16s/bac3 /home/u/16s/bac3o -f 1 -r 1 -a 392 -F zymo
出现以下提醒Traceback (most recent call last):
File "/home/u/figaro/figaro/figaro.py", line 3, in <module>
from . import environmentParameterParser, fileNamingStandards, fastqAnalysis, trimParameterPrediction
ImportError: cannot import name 'environmentParameterParser'
不清楚问题出在哪里，想跟您请教一下，感谢微生物多样性qiime2分析流程(3) 使用figaro来得到dada2正反向截断参数
dada2插件对原始数据paired-end-demux.qza进行质量过滤需要两个参数，trunc-len-f和trunc-len-r。这个想法是通过尽可能多地删除较低质量...
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测序数据质控和预处理之fastp
1. 引言 下机的FASTQ数据通常需要进行质控和预处理，以保证下游分析输的准确性。fastp软件仅扫描数据文件一次，就可以完成FASTQC + cutadapt + T...
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欢迎大家分享自己在完成生信技能树linux作业时的笔记心得 。 生信人的 linux 20题 <http://www.bio-info-trainee.com/2900.html 处理 fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF等**格式（约定成俗，大牛推广）**的数据 fasta和fastq格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3575.html sam和bam格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3578.html VCF格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3577.html
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
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个人学习生信的一点心得 欢迎讨论指摘
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记录学习生信的点滴
