其实我转移到了别的平台，简书很久才看一次，评论看到的时候基本已经过去很多天，另外平时工作繁忙，很少有功夫回复。如果是跟我的教程学习，有卡住的情况，迫切需要我帮助的问题，请参考...
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基于Lasso回归筛选变量构建Cox模型并绘制Nomogram本文转自易学统计基于Lasso回归筛选变量构建Cox模型并绘制Nomogram[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzNw...
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R语言 Logistic回归~模型构建
线性回归模型是研究连续型变量与一组自变量之间的关系。也就是说线性回归模型的因变量是连续型变量。如果因变量是分类变量，则是非线性的，此时需要用Logistic回归，对其发生概率...
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R语言 Logistic回归~变量筛选Logistic回归预测模型思路：1.模型构建2.模型评价3.模型验证 最优模型1.模型能够反映自变量与因变量之间的真实联系2.模型能使用的自变量数目要尽可能的少 模型构建中...
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实用干货 | 基于web的TCGA数据分析工具大集合（内附使用建议）
癌症仍然是人类遗传学家感兴趣的一个关键领域，其中TCGA代表了癌症基因组的一个重大进展，其提供了主要癌症类型中发生的关键基因组变化的全面目录，这些数据有助于更有效的癌症诊断、...
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临床预测模型列线图的评估：校准曲线模型构建完成后需要对模型进行评估和验证其性能。模型预测的生存率与实际的差距有多大呢？一般是看校准曲线。例：一个模型（其C指数为0.8）评估某位患者5年复发率为70%。说明该模...
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iMAP: 单细胞数据整合工具天花板说在前面 Immugent在前段时间的一篇推文中：SciBet:一个软件解决单细胞注释所有烦恼[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4Mj...
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生信综述？带你解锁高分单细胞发文骚操作！
说在前面 我们都知道在科研论文中有两大类：一类是研究型论文；另一类是综述型论文。其中，前者主要是以研究为主的行文思路，根据研究发现的不同发表在不同级别的杂志上；而后者多是本身...
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GSEA会用了，来了解下DGSEA？
差异基因集富集分析(DGSEA)是对Broad Institute / MIT的原始的Gene Set Enrichment Aanlysis（GSEA）分析算法的改进。它是...
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转载---[转录组] 用qPCR验证RNA-Seq挑多少个基因合适？做完RNA-Seq测序之后，往往会用QPCR来验证一下结果。 因为RNA-Seq测序数据得到的结果作为定量参考，参数的改变也会造成结果的不同。所以需要进行qPCR验证，表达水...
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比较三种机器学习模型（随机森林，支持向量机，逻辑回归）的分类效果我把这个思路搬运到我的课题里，复现图如下： 相似度：75%。a和b是用AI画的，所以今天分享下c和d的代码 一 差异分析 假设我们有了这样的一个表达矩阵，叫Expr_all。...
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比较随机森林（RF）和支持向量机（SVM）两种机器学习方法筛选marker能力+ROC曲线绘制最近要中期了，再加上CSC申请即将开始，忙碌而充实的日子又开始了。忙里偷闲更个简书～今天的主题是我课题的一部分，通过五折交叉验证比较随机森林（RF）和支持向量机（SVM）两种...
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表观遗传--RNA甲基化之m6A前沿 表观遗传学，包括组蛋白共价修饰(covalent histone modification)、DNA甲基化修饰(DNA methylation)、RNA甲基化修饰(RN...
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初学者R语言：外部数据导入一.对于TXT文件 1.对于简单文件，可以简单读取，ex1 <- read.table("ex1.txt") 2.对于复杂文件，ex1 <-read.table("文件名如e...
