240 发简信
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    生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析

    写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了,相关脚本、教程也很多,但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间,但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识,不断记录反思,也...

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    ChIP-seq数据分析(一):从raw reads到peaks

    开篇致谢:下面内容的整个框架是跟着生信技能树发布在bilibili上的ChIP-seq视频学习的,链接:https://www.bilibili.com/video/av29...

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    Cytoscape插件3:Enrichment Map(1)

    富集分析 早期的基因列表解释依赖于选择一系列高得分的基因,然后建立相当主观奇怪的关系。富集分析是一个自动的,基于严格的统计学的方法来分析和解释很大的基因列表,使用的是先验知识...

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    Trim Galore ——自动检测adapter的质控软件

    之前分析过的测序数据,数据质量都很好,给了我一个错觉质控的前后差别不是很大,内心里对质控这一步也就不是很重视,跑完质控有时也懒得看结果,拿到一批测序数据后,也总是忽略了去看测...

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    我的ChIP-Seq(4):MAnorm差异分析

    哈哈,搜了一圈没发现网上有关于MAnorm的中文教程或者是说明,本文将是第一篇~撒花✿✿ヽ(°▽°)ノ✿那就要用心写了,感到鸭梨.jpg== 首先,MAnorm是什么,可以做...

  • 「r<-Shiny」响应式编程(二)响应式编程

    一个网页应用仅有输入控件或输出控件无疑是枯燥的。Shiny 真正的魔法在于它同时包含两者。 下面看一个简单例子: 通过下面的截图我们观察向该应用输入时产生的变化。 我们可以看...

  • R中的S3和S4简介

    R语言有四大类型系统:基础类型、S3类型、S4类型和RC类型。 R虽然被认为是一种函数式语言,但是同样支持面向对象编程,意味着R将对象作为程序的基本单元,将程序和数据封装其中...