菜鸡
发简信
IP属地：浙江
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基于参考基因组的基因组组装和注释
将基因组组装到染色体水平无非就是两种方式： 独立组装（de novo）； 基于参考基因组的组装（reference-guided），即基于近缘或同一物种的基因组染色体同源性进...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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RagTag, 快速锚定config
RagTag, Reference-guided genome assembly correction and scaffolding. 是Ragoo的一个升级，可对cont...
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基于VCF文件做基因渗入分析(Dsuite)Dsuite软件文章：Malinsky, M., Matschiner, M. and Svardal, H. (2021) Dsuite ‐ fast D‐statisti...
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学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
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snpEff注释变异位点信息SnpEff是一种变体注释和效果预测工具，它注释和预测遗传变异的影响（例如氨基酸变化）。 1. 软件安装 2. 运行 2.1 构建SnpEff数据库 SnpEff软件的运行，...
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基因家族分析保姆级教程（分子进化）-生信小白自学之路（一）一、基因家族基础知识与研究思路介绍 1.基因家族简介 基因是染色体上一段可以发生转录的区域（内含子外显子启动子）。转录本才是基因的研究实体，转录本transcript（别名 ...
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maker基因组注释一（基础篇）在基因组注释上，MAKER算是一个很强大的分析流程。能够识别重复序列，将EST和蛋白序列比对到基因组，进行从头预测，并在最后整合这三个结果保证结果的可靠性。此外，MAKER还...
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基因组组装项目的十二步建议1. 建立项目团体 多机构合作，数据和利益共享。 2. 收集目标基因组信息 考虑的因素：基因组大小、倍性、杂合性、GC含量和重复。 数据库查询：fungi (http://w...
