scVelo于2020年发表在Nature Biotechnology[https://www.nature.com/articles/s41587-020-0591-3]，...
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使用scVelo进行RNA velocity分析-01 -
10X单细胞（10X空间转录组）RNA速率分析之scVelo今天我们测试一下软件scVelo，这个软件应该很多人都用过了，但是玩的好的人，应该没几个。 加载 读取数据（loom, h5ad, csv）, 我的数据是根据velocyto...
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R语言批量爬取NCBI基因注释数据网络爬虫（web crawler），也叫网络蜘蛛（spider），是一种用来自动浏览万维网的网络机器人。其目的一般为编纂网络索引。各大搜索引擎都可以被看做爬虫，根据爬取的内容...
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R-loop数据分析之R-ChIP(样本间BAM比较和可视化)样本间相关性评估 上一步得到各个样本的BAM文件之后，就可以在全基因组范围上看看这几个样本之间是否有差异。也就是先将基因组分成N个区间，然后用统计每个区间上比对上的read数...
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ggplot2画图：legend整理(title/position/order...)修改一组legend，导入iris数据集，默认画图： 修改legend的题目 (title) 修改legend的位置 (position) 修改位置有两种方式，一种是直接给出...
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这种标题除了营造一种焦虑感，并无甚用！
筛个差异基因为什么就7分了？
今天跟大家分享的是2019年3月发表在J.Crohns.Colitis （IF：7.827）杂志上的一篇文章High-Throughput Identification of...
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matplotlib可视化之如何给图形添加数据标签？当我们获取完数据之后，一般来说数据可视化呈现的最基础图形就是：柱状图、水平条形图、折线图等等，在python的matplotlib库中分别可用bar、barh、plot函数来...
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单细胞转录组||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jianshu.com/p...
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你到底想要什么样的umap/tsne图？随着生物学背景知识的增加，单细胞图谱的可视化直接用10X的Loup或者seurat的Dimplot函数直接绘制的umap/tsne图往往很难达到要求了，这就要求我们提高绘图技...
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Ubuntu完全教程，让你成为Ubuntu高手！
Ubuntu的发音 Ubuntu，源于非洲祖鲁人和科萨人的语言，发作 oo-boon-too 的音。了解发音是有意义的，您不是第一个为此困惑的人，当然，也不会是最后一个：）大...
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2019-08-06用ggplot2绘制两侧柱状图1、首先构建一个虚拟的数据 2、绘制基本图形 3、不好看😝，调整一下坐标轴 4、好多了，再改改排列顺序 5、还差点什么，对了，把数字标注到柱子上 6、最后用ggtheme美颜...
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单细胞测序实战（第一部分）这次要练习的文章数据出自：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...
