IP属地：河北
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我的aspera密码，我怎么没印象我有这个密码呢？能给解释一下吗
2020-09-29 使用Aspera从EBI或NCBI下载基因组数据
来源：https://www.plob.org/article/3013.html[https://www.plob.org/article/3013.html]做基因组数据...
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什么时候可以毕业ಥ_ಥ
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@haiyong6 谢谢
cpolar实现免费的内网穿透
背景 虽然自己有一台阿里云的服务器，但是限于云服务器的配置不高，存储也不大，想着以后如若有扩展存储的需求与其购买加钱，不如自己在本地搭一个树莓派跑一些自己需要的服务。但是绝大...
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@haiyong6 这两个哪个好用一些呢？
cpolar实现免费的内网穿透
背景 虽然自己有一台阿里云的服务器，但是限于云服务器的配置不高，存储也不大，想着以后如若有扩展存储的需求与其购买加钱，不如自己在本地搭一个树莓派跑一些自己需要的服务。但是绝大...
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samtools fastq本身就能转换成fastq文件，没必要换一个软件，samtools就是一个神器
从BAM文件提取unmapped reads并转换成fastq格式
用到的程序，samtools和bedtools，都用conda安装。 目标是将第一次比对的bam中unmapped reads提取出来，并转换成fastq进行下次比对。 第一...
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@李昭_hzau 谢谢，这种拆分染色体跑出来的结果会不会影响整体的区间计算呢
DeepBSA的使用介绍
简介：混池测序分析（Bulked segregant analysis）是一种省时省力、广泛应用于挖掘性状遗传位点的方法，已有多种相应算法被开发出来。包括基于高低池等位基因频...
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这个太耗资源了，一般电脑跑不动，载入VCF文件直接卡死重启了，没有Linux版本😭
DeepBSA的使用介绍
简介：混池测序分析（Bulked segregant analysis）是一种省时省力、广泛应用于挖掘性状遗传位点的方法，已有多种相应算法被开发出来。包括基于高低池等位基因频...
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1和2好像没什么区别
anaconda3 | 使用中常见错误
1. conda安装环境报错：Solving environment: failed with initial frozen solve. 方案1：首先，把你安装的anaco...
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总结的不错，WGDI把共线性分析做到了极致，JCVI把可视化做到了极致，其实WGDI的结果文件可以调整一下，用JCVI可视化
分析 | 比较基因组 | 共线性分析
网上已经有很多教程，自己尝试梳理。 共线性分析，你会想到什么？基于蛋白编码基因1.1 MCScanX[https://github.com/wyp1125/MCScanX] ...
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@卖萌哥 没必要过滤吧？ LACHESIS 不是有个设置参数吗 CLUSTER_MAX_LINK_DENSITY
lachesis辅助组装流程
准备工作： 准备数据参考基因组：Ler-1.allpaths_lg.final.assembly.fastaHiC数据：data_1.fastq.gz data_2.f...
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我提的问题居然被采纳了👍
小工具 | 滑窗计算GCskew / GCratio / Nratio
写在前面 最近可以用来工作的时间少得可怜...但项目总归是要一步一步推进。每天都可能会怀疑人生，然后遗忘或者突破这个怀疑。或许这就是人生无可奈何的一部分。回到主题。前述，开设...
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@vicLeo 最后我用conda安装java11解决了，非常感谢作者的分享
snpEff注释vcf前构建库的Error ：CDS check file cds.fa' not found. Protein check file not found. Database c...
conda activate java12 #进入还有java高版本的conda所属环境snpEff #启动 snpEff 构建小鼠的数据库 先进入 snpeff-5.1-1...
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请问怎么在conda 环境里安装java12呢？
snpEff注释vcf前构建库的Error ：CDS check file cds.fa' not found. Protein check file not found. Database c...
conda activate java12 #进入还有java高版本的conda所属环境snpEff #启动 snpEff 构建小鼠的数据库 先进入 snpeff-5.1-1...
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很棒的教程，请问蛋白对接好之后怎么得到精确的互作位点呢？
来一场蛋白与蛋白间的“风花雪月”
一、引子 2005年，Wigge等【1】在《Science》上报道了拟南芥“诱导开花”的信号调控通路，简言之：在拟南芥体内，一个叫做FLOWERING LOCUS T (...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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@bio_meow 我做了，那个scale只能做行或者列的标准化，做完图就不是对称的了
R相关性分析和相关性热图
相关性分析 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程...
