前言 肝细胞癌（HCC）是世界上第五大常见癌症，以及全球癌症死亡的第五大原因。大部分HCC患者出现转移，其中肺转移的总体生存率约5.9月，无转移患者总体生存率约16.2月。肺...
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Hepatology：M2型巨噬细胞来源外泌体通过αMβ2 整合素促进肝癌转移
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IF 41！肿瘤单细胞研究新思路：乳腺癌中新巨噬细胞类群发现与研究在我国，乳腺癌发病率呈逐渐上升趋势，是严重危害妇女健康的恶性肿瘤。巨噬细胞是乳腺癌微环境的主要细胞类型。肿瘤相关巨噬细胞通常具有促癌和免疫抑制功能，与不良预后相关，但也有报道...
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GO和KEGG富集结果如何显示基因symbol
前面在讲GO和KEGG富集倍数（Fold Enrichment）如何计算[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin....
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使用clusterProfiler进行GO、KEGG富集分析（有参情况）寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显，这些差异的基因必然与功能改变密切相关，例如，比较患病个体与正常个体的组织表达谱，不难想到这些显著...
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【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小结
前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了，网红教授宣传得很成功，功能也比较强大，主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。简单总结下用法，以后用时可直接找...
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利用NetworkAnalyst工具进行基因差异分析NetworkAnalyst是个集基因表达和荟萃分析的可视化在线分析平台，分析内容包括：差异分析、功能分析和网络分析。 NetworkAnalyst在线工具网址：https:...
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ID转换、利用clusterProfiler做GO、KEGG富集分析
首先需要加载的包 需要准备的文件 包含gene列表的txt或csv文件,如“genelist.txt” 格式为ENSEMBL 一、读取表格 二、ID转换 三、富集分析 （1）...
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GO富集分析＼KEGG
##Time:2017-10-8 ##Author:Feng Shengyu #-----------------------------------------------...
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GO，KEGG，DO富集分析这是我听B站鲮鱼不会飞视频（GO，KEGG，DO富集分析）里的笔记哦~当然有的地方加上的是我自己的理解，如果哪里和视频上讲的不一样那是我自己发挥的，自行忽略.... 市面上公...
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TCGA转录组差异分析后多种基因功能富集分析：从GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID转换）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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简单、快速，KEGG批量注释--kobas如何实现本地化
注意 ：kobas支持python2 版本，本文安装使用的是Centos 7.4系统 pip安装： （1）出现的问题网址：https://www.cnblogs.com/sa...
