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    TCGA 数据下载分析利器 —— TCGAbiolinks(二)临床数据下载

    获取临床信息 TCGAbiolinks 还提供了一些用于查询、下载和解析临床数据的函数,GDC 数据库中的包含多种不同的临床信息,主要包括: indexed clinical...

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    生信log21|基因组成圈了吗?-拼接路径可视化软件Bandage结果详解

    在实验室经常听到师兄师姐评估基因组提到一个点就是,基因组能拼成圈吗,当时还是生信小白(现在是个资深小白)的我仅仅见识过circos的华丽图片,以为他们口中所说的成圈是circ...

  • 为什么要去掉生存天为0呀

    TCGA基因表达数据和生存数据合并

    打开临床数据excel,分别自定义排序futime和fustat,futime中去掉生存天数为0和没有的数据,fustat中去掉无生存状态的数据(1为死亡,0为存活) 将上图...

  • 学习能力

    拥有有学习能力的人,就好像有了“外挂”一样。需要什么就可以学什么,这不就是“作弊器”。但是很可惜,绝大多数人在这一生处于装备不全或者落后的状态,又何谈开挂? 谁没有一颗上进的...

  • 「r<-Shiny」工作流(二)调试

    当你开始编写应用程序时,几乎可以确定会出错。导致大多数错误的原因是我们心里的 Shiny 设计模型与 Shiny 实际的运行情况的不匹配。当你阅读本文时,你的思维模式将得到改...

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    48个实用的生信在线工具

    在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点,轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。 基因结构绘制 1.Exon-Intron Graphic Mak...