参考基因组下载有三大全文网站提供参考基因组下载,它们分别是:1.NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc)2.UCSC (http://h...
作业要求 我们统一选择p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因为显著差异表达基因集,对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分析。然后把表达矩阵和分组信息分...
一、生存分析R语言基础 我们将使用两个R包:survival 用于计算存活分析survminer 用于总结和可视化生存分析结果 结果展示: 二、2万个基因的身存分析(循环)
图片好像加载不出来,可移步:https://blog.csdn.net/qq_38774801/article/details/114952565[https://blog....
年后开工第二天,忘了开机密码不说,甚至忘记了自己先前是干什么工作的。哎~~~~依旧在暴躁中。。。。只能通过整理之前工作来找回状态。闲话少说。 1、安装和载入安装的具体方法就那...
提取 分别用rsem,kallisto,Salmon定量得到每个样本isoform的定量文件,提取了transcript_id一列和count一列,并且增加了序号列,使得每个...
对于非模式生物或者无参考基因组的项目,经常需要进行基因的功能注释,而GO注释是基因功能注释的重要部分。有很多软件能够获得GO注释的信息,例如interproscan、eggn...
想通过xlsx包中的函数去读取excel表格,分批安装需要的包: 但是发现想读包的时候,一直报错。根据网上很多教程在win下配置了JDK的环境,但是重复导入库还是不成功。一直...
转录组有参分析之STAR比对及可变剪切 STAR比对的特点: 速度快 准确度高 3'reads soft clip genomeLoad LoadAndKeep 多个比对共享...