@xwl123 grep "^name:" go-basic.obo | awk -F ': ' '{print $2}' > GO.name
以冒号和空格做分隔符就可以了
比较基因组学分析3：特异节点基因家族富集分析（非模式物种GO/KEEG富集分析）比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
确实，这样会导致description列只有一个单词，最后作气泡图导致有重复的列
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在注释库构建的第一步里，grep "^name:" go-basic.obo |awk '{print $2}' > GO.name ，最好不要直接print $2，这样会导致只有一个单词进入GO.class中，可以直接sed掉name:
请问下4.4步骤KEGG注释生成中的命令：
gene2pathway <- gene2ko %>% left_join(ko2pathway, by = "KO") %>%
dplyr::select(GID, Pathway) %>%
na.omit()
会报如下错误：
Error in is.data.frame(y) : object 'ko2pathway' not found
请问下是怎么解决的......😭
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你这个gtf文件格式介绍不对，第三列是feature，例子给的也完全不对
基因组注释文件（二）| gff 和 gtf文件格式说明简介 GFF和GTF是两种最常用的基因组注释格式，在信息分析中建库时除了需要fasta文件一般还会需要这两种文件，提取需要的信息进行注释。 一、GFF GFF(General...
