发简信
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纯生信发文的新技能，同一份GEO数据可以发两篇SCI
为什么有些人总是能发好几篇纯生信SCI？因为人家掌握了方法，例如利用同一份GEO数据可以发两篇SCI，具体操作如下： 第一篇纯生信SCI可以这样做： 第一步，数据下载处理、合...
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文献学习010--[sc]重症新冠患者外周血抗原呈递细胞单细胞测序揭示多种抗病毒免疫过程缺陷文章代码见：https://github.com/MelissaSaichi/Covid_scRNAseq[https://github.com/MelissaSaichi/...
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Linux5-软件安装Linux基础课程系列： Linux1-文件目录操作命令[https://www.jianshu.com/p/ce0dd642afc8] Linux2-权限与远程管理[htt...
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Linux3-Vim编辑器Linux基础课程系列： Linux1-文件目录操作命令[https://www.jianshu.com/p/ce0dd642afc8] Linux2-权限与远程管理[htt...
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免疫细胞注释-1：T细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
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生物信息学常见数据格式1. fasta fasta 是一种基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式。其中核酸或氨基酸均以单个字母来表示，且允许在序列前添加序列名及注释。 特征：2部分--id行和序...
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单细胞之富集分析-4：分组水平GSVA单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 单细胞之富集分析-2：批量...
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单细胞之富集分析-3：GO和KEGG富集分析及绘图单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 单细胞之富集分析-2：批量...
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文献学习008--[sc]两篇PBMC单细胞文献阅读1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
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基因表达趋势分析-1：TCseqTCseq包可以应用于转录组，单细胞转录组，ATAC-seq，Chip-seq等的表观基因组时序型数据分析。该包主要用于不同时间点的差异分析，时间趋势分析及可视化作图。 官网...
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使用ggplot2优化Seurat绘图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] Seurat是分析单细胞数据一个非常好用的包，自带...
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文献学习006--[sc]单细胞测序揭示COVID-19严重性与呼吸道上皮和免疫细胞的相互作用相关摘要：新冠患者SARS-CoV-2 entry受体ACE2的表达比正常高了3倍，并与免疫细胞的干扰素表达相关。和中度患者相比，重症患者显示出更强的上皮细胞免疫细胞互作，引起免...
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3大差异分析r包：DESeq2、edgeR和limma做差异分析需要的数据：表达矩阵和分组信息TCGA的数据只要表达矩阵就够了，因为其TCGA的样本ID比较特殊，样本ID的第14和15位是>=10还是<10就代表了这个样本是正常...
