Inflammatory profiles and checkpoint landsscape(PMID: 32201203[https://pubmed.ncbi.nlm....
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免疫知识点 -
Seurat的打分函数AddMouduleScore在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的AddMouduleScore函数...
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RNASeq实战练习-hisat2比对与featurecounts定量
hisat2 构建索引 hisat2 比对 hisat2 比对软件将 reads 比对到参考基因组[https://www.jianshu.com/p/e9cebbd8ef5...
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enrichplot||基因富集结果可视化解决方案enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. 201...
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偏最小二乘（pls）回归分析姓名：车文扬 学号：16020199006 转载至：https://blog.csdn.net/revitalise/article/details/82530693，有删节...
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19种回归分析你知道几种？只要学习过数据分析，或者对数据分析有一些简单的了解，使用过spssau、spss、stata这些统计分析软件，都知道有回归分析。按照数学上的定义来看，回归分析指研究一组随机变...
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回归分析介绍（上）
回归分析（regression analysis)是确定两种或两种以上变量间相互依赖的定量关系的一种统计分析方法。运用十分广泛，回归分析按照涉及的变量的多少，分为一元回归和多...
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孙振球, 徐勇勇. 医学统计学.第4版[M]. 人民卫生出版社, 2014. 从R语言和统计学小白的过渡。。。 更加优质的阅读体验：https://x2yline.github.io/statistics_note/ 简书不支持latex语法。。。
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调节效应分析（自变量为连续变量或分类变量）一、什么是调节效应 调节效应就是说因变量与自变量的关系受到第三个变量即调节变量的影响。 举个栗子： 之前很火的电视剧《三十而已》，许太太和许幻山之间是夫妻关系，第三者林有有出...
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DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap绘制带特定基因的单细胞热图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
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R---plot()参数详解plot是R中的基本画图工具，直接plot(x)，x为一个数据集，就能画出图。细节往往制胜的关键，所以就详细来看下plot的所有可设置参数及参数设置方法。 下面讲到的图形参数...
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monocle细胞轨迹追踪原理我们用seurat选取HVG来进行细胞轨迹推断，并且过滤了一些低质量的细胞 加载相应的工具包 本文的数据和预处理来源于：单细胞之轨迹分析-2：monocle2 原理解读+实操...
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R语言：R语言调色板相信各位在肝图表写论文时，一定都会思考：这张图表用啥颜色？论文整体配色搭配怎么把控才好看？ 毕竟高分期刊大牛文章的共通点，除了论文精彩，整体配色也十分具有吸引力。 许多在线配...
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seaborn + matplotlib 画图(一): 小提琴图，箱型图
Seaborn 是一个基于 matplotlib[https://matplotlib.org/] 且数据结构与 pandas[https://pandas.pydata.o...
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[scRNA-seq]doublets检测——DoubletFinder & scrublet （下）在上一篇文章里我们聊到为什么要进行doublet检测，以及DoubletFinder的基本算法。在这篇文章里，我们就来聊聊另一个doublet检测工具——scrublet的基...
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python分析单细胞数据，多细胞去除的模块hi，各位道友，上次我们介绍了R包DoubletFinder用于去除多细胞那么python是否也有类似的模块去除多细胞呢，答案是有的。这次我们就来使用一下python模块去除...
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这个世界流行离开，但我们却不擅长告别
