240 发简信
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  • @To_2020_1_4 你好,用fastq的时候遇上一个问题,前两天做单端和双端测序的质控时都没有遇上问题,都能得到质控的结果,但是今天又回来一批数据要质控,但是一直报错,提醒找不到的这些文件其实都有在,统一用集群跑得时候一直报错,但是单挑拿出来跑又不会,很苦恼
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    ERROR: file 'fastq/SES-MC-rep1_1.fq.gz' doesn't exist, quit now
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    ERROR: file 'fastq/SES-BSC-rep1_1.fq.gz' doesn't exist, quit now
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    ERROR: file 'fastq/SES-SC-rep1_1.fq.gz' doesn't exist, quit now

    使用fastp进行数据质控

    fastp是一款较新的数据质控软件,接触这个软件也是由于目前市场的软件各有功能但是功能都不是很全,譬如最近接触到一个RNAseq数据,质量较差,需要去除接头而且含N较多,序列...

  • @To_2020_1_4 好的,非常感谢!

    使用fastp进行数据质控

    fastp是一款较新的数据质控软件,接触这个软件也是由于目前市场的软件各有功能但是功能都不是很全,譬如最近接触到一个RNAseq数据,质量较差,需要去除接头而且含N较多,序列...

  • 你好,请教个问题,我的同一个植株取了不同的组织进行测序后回来的数据用fastq进行质控,是需要每一个样本出一个fastq.html,还是全部的组织出一个fastq.html的文件
    谢谢

    使用fastp进行数据质控

    fastp是一款较新的数据质控软件,接触这个软件也是由于目前市场的软件各有功能但是功能都不是很全,譬如最近接触到一个RNAseq数据,质量较差,需要去除接头而且含N较多,序列...