一，VSCODE配置Markdown 打开左侧的extensions，或者使用 Ctrl+Shift+X，输入MarkdownMarkdown相关插件下载安装（1）Markd...
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VSCODE配置Markdown，以及Markdown基础语法
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学Markdown看这一篇就够了：Markdown 教程
什么是 Markdown Markdown 是一种轻量级标记语言，它允许人们使用易读易写的纯文本格式编写文档。Markdown 编写的文档可以导出 HTML 、Word、图像...
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R语言可视化（二）：折线图绘制02.折线图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 base plot函数绘制普通折线图 ggplot2包绘制带误差棒的折线图 ggplot2包绘制聚类趋势折线图
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ggplot2 - 折线图geom_line: 按变量在x轴上的顺序连接 geom_path: 按变量在数据中出现的顺序连接 折线图的美学映射有： x y group alpha size linet...
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ERROR: dependency ‘XML’ is not available for package ‘annotate’在做RNA-SEQ时候，用hisat2，stringtie，ballgown流程，在过程中需要'genefilter','dplyr','devtools','ballgow...
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利用subset函数取子集subset 第一个要输入的参数是你的数据框，第二个要输入的参数是你对于观测（行）的筛选，可以用逻辑运算符串联，第三个可选择输入的是你要选择的列（变量）。跟之前一样的筛选条件...
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R aggregate()函数一：介绍： aggregate函数是数据处理中常用到的函数，具有强大的功能。可以按照要求把数据打组聚合，然后对聚合以后的数据进行加和、求平均等各种操作。具体说明可使用命令：h...
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数量生态学笔记||非约束排序||PCoA主坐标分析（Principal Coordinates Analysis ,PCoA, =Classical Multidimensional Scaling ，cMDSca...
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非参数检验：Wilcoxon检验引言 Wilcoxon检验（也被称为Mann-Withney-Wilcoxon检验）是一种非参数检验，意味着它不依赖于属于任何特定参数的概率分布家族的数据。非参数检验的目标与...
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R数据可视化2:箱形图 Boxplot日更已经是不可能的了，让我向周更靠齐。本节我们来讲箱形图（Box-plot）。 什么是箱形图 箱形图（Box-plot）是一种用作显示一组数据分散情况的统计图，因形状如箱子而...
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【R>>RColorBrewer】神仙函数colorRampPalette首先声明下面整理的内容都来自于网络，并在文末注明了引用的出处，本内容仅用于学习交流，禁止用于商业用途，如有侵权，请联系删除。目前自己常用的调色R包有： ggsci[http:...
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在R中如何修改dataframe中指定列的名称？
通用式的修改方式： 也可以指定： 如果列比较多，也可以考虑全部重命名： 参考：how-to-rename-a-single-column-in-a-data-framecha...
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R语言 改变列的名称 change column names
利用colnames(df)获取dataframe的所有列的名称，之后的操作便在此基础上展开 综上可以看出，右侧为列的新名称字符串或者向量，左侧的重点在于找到需要重命名的列的...
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Phylogenetic tree——系统发育树的生成有人说生命科学的所有问题的答案都应该到进化里寻找，还有人说不懂进化的生命科学家是耍流氓。 系统发育树或进化树是一种常用来表示物种宗谱亲缘关系的树状结构图。在分子水平，亲缘关系...
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99-非监督学习之hclust分层聚类k-means 输出为扁平的聚类结果，分层（层次）聚类输出为树状的聚类结果，当数据为多层级结构时适用。层次聚类(hierarchical clustering)基于簇间的相似...
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数量生态学笔记||层次聚类本周开始我们的《数量生态学笔记》的第四章：聚类分析。聚类分析又称群分析，它是研究（样品或指标）分类问题的一种统计分析方法，同时也是数据挖掘的一个重要算法。在生态学研究当中，聚...
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WGCNA实例分析及解读（附代码）WGCNA分析基于两个假设：1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路，2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点，可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...
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小鬼的WGCNA图文详解(三)--聚类树Cluster Dendrogram图还是老习惯，给出官网教程，至于你是看还是不看，它就在那里，等着你的深入研究～ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coexpress...
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R语言绘图包10--Circos图的绘制：circlize包R语言绘图包系列： R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] R语言绘图包02--热...
