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Front Immunol 复现|1. GEO数据下载及sva批次校正(PCA可视化)Front Immunol 复现|1. GEO数据下载及sva批次校正(PCA可视化) 前几天有同学问了一篇文章里的一个方法的实现，看了一下这篇文章除了qPCR验证基本都是纯...
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转录组数据分析—clusterProfiler富集分析差异分析之后，为了了解我们获取的差异基因的功能及参与的生物学进程，我们需要对差异基因进行功能富集分析。基因富集分析（gene set enrichment analysis）...
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一份超真诚的生信小白学习旅程分享
花花导读ing 哈！第一次占据导读位置，有点不习惯。今天做了TCGA课程试讲，又是一份新的挑战了。讲到11点没时间写干活分享了，但好想起有位学习小组的学员提交了一份非常走心的...
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科研新热点——血管生成相关基因前面小编给大家分享了几个科研中经常用到的基因集，以及如何使用这些基因集进行相关分析。 ☞ m6A甲基化相关基因集[https://link.zhihu.com/?target...
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分享各种各样的科研日常。
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根据免疫细胞浸润情况鉴定新的预后相关基因特征Identification of a Novel Prognostic Gene Signature From the Immune Cell Infiltration L...
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R—生存分析—Kaplan-Meier + Log-rank test + Cox回归参考教程：http://www.sthda.com/english/wiki/survival-analysis-basics[http://www.sthda.com/en...
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OS/PFS/DSS/DFS-各种生存指标的区别
OS 总体生存期：Overall Survival定义： 结局指标是死亡时间，这个死亡是任何原因导致的死亡都算进去，只关心是否死亡，不关心因为何种原因死亡。 优点 ：能比较方...
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TCGA Cox模型-训练集、内部验证集、外部验证集综合构建Cox风险模型③
前面我们已经进行了单因素Cox回归，LASSO回归及多因素Cox回归建模，而我们想对建好的模型进行验证，本例通过内部验证组和外部验证组对Cox模型进行内部验证和外部验证，并对...
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xCellx详细使用方法及结果分析理论知识： 组织是由不同谱系和亚型的细胞类型组成的复杂环境，每种细胞都有自己独特的转录组。因此，批量转录组分析是细胞类型特异性基因表达的总和加权的细胞类型比例在给定的样本。去...
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不做WB或免疫组化，也能轻松完成蛋白验证 | 蛋白组数据库推荐
分子实验的常规检测内容除了基因就是蛋白啦，ELISA、WB、免疫组化...理论知识很扎实，可是实验结果却很扎心，比如WB，条带总是那么不正常，要么没有，要么弥散，要么非特异。...
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microRNA数据库与预测、功能分析软件大全
在microRNA的研究中，生物信息学发挥越来越重要的作用，以下是microRNA相关的数据库与预测、功能分析软件，绝对值得收藏。 1.miRBase: http://www...
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免疫浸润分析经典套路解读
该文章发表在frontiers in Oncology杂志上的一篇文章，IF=4.137。头颈癌（HNC）的免疫浸润与患者的预后密切相关，然而，之前的研究未能解释免疫系统的多...
