生信小白一枚，我不是牛人，我只是一头开荒牛，希望大家能在我的学习基础上更进一步，共同提高！
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Recv failure: Connection reset by peer 这是为啥子
如何获取kegg通路的基因列表
如何获取kegg通路的基因列表？相信很多人都有这个疑惑。 哪些时候需要知道通路的基因列表？举两个例子： 在找差异基因这一步，只想针对特定通路的基因去找。可以在找完差异基因后，...
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如何获取kegg通路的基因列表
如何获取kegg通路的基因列表？相信很多人都有这个疑惑。 哪些时候需要知道通路的基因列表？举两个例子： 在找差异基因这一步，只想针对特定通路的基因去找。可以在找完差异基因后，...
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中科院硕博生一枚，用简书来记录自己精读paper和学习生信的过程。
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[ggplot2]跟着Y叔学ggplot2（一）
1.数据和映射 把数据中的变量映射到图形属性上 映射完成后，要告诉ggplot2展示出什么样的几何图形，以散点图为例 如果想将切工(cut)映射到图形属性[也就是再添加一列数...
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为什么没有生存时间啊😨😨😨
2022新版TCGA数据下载与整理
2022年4月份TCGA进行了更新，测序数据变成了STAR-count文件。以往count文件是htseq.counts.gz格式，现在变成star_gene_counts....
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为什么下载到expdata和clinical是一样的文件
2022新版TCGA数据下载与整理
2022年4月份TCGA进行了更新，测序数据变成了STAR-count文件。以往count文件是htseq.counts.gz格式，现在变成star_gene_counts....
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Barcode file missing. Expecting barcodes.tsv.gz
Seurat包合并多个单细胞样本
示例数据：GSE139324有63个samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1393241...
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每个文件夹里均为matrix.mtx.gz、features.tsv.gz、barcodes.tsv.gz，可还是提示Barcode file missing. Expecting barcodes.tsv.gz，这是为啥呢，求大神告知啊
Barcode file missing. Expecting barcodes.tsv.gz
常见错误： 说找不到Barcode文件，但明明存在Barcode： Error in Read10X() : Barcode file missing那很有可能是因为三个10...
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单细胞测序分析: Seurat V3联合harmony进行单细胞数据整合分析#R包导入 #数据 数据下载pbmc_stim 数据导入 #初始化Seurat 对象 使用Harmony之前，需要构建一个Seurat对象， 进行一个标准的Seurat分析（...
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就喜欢一行一解释的，这比枯燥的听基础语法有趣👍👍👍👍
热图——pheatmap学习
热图——pheatmap学习代码及参数如下： 仅展示热图汇总得结果！ 参考：pheatmap.pdf (r-project.org)[https://cran.r-proje...
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跟着Nature学作图：R语言ggplot2分组折线图添加误差线论文是 Environmental factors shaping the gut microbiome in a Dutch population 数据和代码的github...
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【CIBERSORT】超详细，从数据下载到数据分析（初学者笔记）【CIBERSORT】超详细，从数据下载到数据分析全过程(初学者笔记) cibersort是目前引用次数最多的免疫细胞浸润估计分析工具，2015年首次发表于nature me...
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12.GEO数据集的R语言差异分析和代码解析—1.数据下载和整理一、举例介绍 本节下载GSE1009数据集，使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量：共6个样本，其中3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本，另3个为正常肾小球...
