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LDSC不仅仅可以用于计算以及检验GWAS结果的inflation是否是因为混杂因素(confounding)的影响,还可以有S-LDSC(pa...
一、什么是LDSC? image.png LDSC,LD分数回归,2015年由 Brendan K Bulik-Sullivan 提出的方法,旨...
一、孟德尔随机化(Mendelian Randomization, MR)的原理 随机对照实验(RCT)一般被认为是明确因果关系的金标准。其要求...
当我们拿到某个研究的GWAS summary data时,因为大多是二代测序的缘故,它的SNP ID可能不是正常的rsid,但是,我们下游有些分...
整体脚本如下,需要你的文件包含CHR BP P三列,无所谓顺序,也无所谓有啥其他列,只要有这三列即可 结果如下
mwget,m就是multi多线程的意思。mwget是wget的升级版,支持多线程下载,且默认为短点续传。 1、软件安装 当然,我是推荐直接在g...
道心崩碎,先沉寂一段时间
在我们学习某些东西的时候,经常会用pdf、markdown文件或者ipynb文件等去记录一些分析过程,但是如果文件比较多并且比较长的时候,后面查...
最近在学习R,在这里介绍下ggplot绘制的各种图形及代码,还是非常好用的 1 数据 用的数据是R中自带的mpg数据集,长这样(部分) manu...
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