论文 Reference genome assemblies reveal the origin and evolution of allohe...
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跟着NatureGenetics学作图：R语言ggplot2做进化树图及添加不同形状的背景色块 -
群体选择信号分析群体进化与选择信号：●生活在世界不同区域的生物群体在历史长河中经历千万年的自然选择、人工驯化、迁徙、遗传漂变等事件的洗礼，有的物种灭绝，有的物种...
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11.GWAS：确定候选区间
确定了与表型显著的SNP位点后，通常会选择在显著性位点所在位置前后，各一定的距离内，确定候选区间，进行候选基因挖掘，而这个距离如何确定？9.5 ...
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PLINK+TASSEL做GWAS+Post-GWAS分析此视频来自B站，是非常好和全的的一个GWAS操作的视频，从开始准备软件下载，数据过滤，到最后的候选基因注释。GWAS的实战视频https://w...
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GATK4测试学习
Getting-started-with-GATK4 GATK代表GenomeAnalysisToolkit。 它是用于分析高通量测序数据的命令...
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gatk4使用总结
昨天看了gatk的官网，从2018年发布正式版的4.0.0开始，到现在已经更新到4.1.8，在速度和准确度上都有了大幅的提升。gatk4除了整合...
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Samtools reheader
Usage 实操流程
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2021-05-07没有bam文件没有RG
问题起因：在用gatk进行HaplotypeCaller时，报错 原因是在用hisat2或者bwa比对是没有添加RG；hisat2（参数为--r...
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sambamba的安装
下载文件 这个时候可能会报错 这是因为没有安装ldc这个库，那么就先来安装ldc这个库 然后再来安装sambamba
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WES中常见问题汇总参考链接： https://mp.weixin.qq.com/s/awdjoXRYobrQAbXmAp3C0g gatk4的使用：https:/...
专题公告
GWAS分析流程及可视化
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