论文 Reference genome assemblies reveal the origin and evolution of allohe...
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跟着NatureGenetics学作图：R语言ggplot2做进化树图及添加不同形状的背景色块 -
11.GWAS：确定候选区间
确定了与表型显著的SNP位点后，通常会选择在显著性位点所在位置前后，各一定的距离内，确定候选区间，进行候选基因挖掘，而这个距离如何确定？9.5 ...
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PLINK+TASSEL做GWAS+Post-GWAS分析此视频来自B站，是非常好和全的的一个GWAS操作的视频，从开始准备软件下载，数据过滤，到最后的候选基因注释。GWAS的实战视频https://w...
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GATK4测试学习
Getting-started-with-GATK4 GATK代表GenomeAnalysisToolkit。 它是用于分析高通量测序数据的命令...
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gatk4使用总结
昨天看了gatk的官网，从2018年发布正式版的4.0.0开始，到现在已经更新到4.1.8，在速度和准确度上都有了大幅的提升。gatk4除了整合...
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Samtools reheader
Usage 实操流程
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2021-05-07没有bam文件没有RG
问题起因：在用gatk进行HaplotypeCaller时，报错 原因是在用hisat2或者bwa比对是没有添加RG；hisat2（参数为--r...
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sambamba的安装
下载文件 这个时候可能会报错 这是因为没有安装ldc这个库，那么就先来安装ldc这个库 然后再来安装sambamba
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WES中常见问题汇总参考链接： https://mp.weixin.qq.com/s/awdjoXRYobrQAbXmAp3C0g gatk4的使用：https:/...
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讨厌又迷人的reads去重复在NGS分析入门阶段，我们不需要考虑太多的细节，只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节，只会让我们对于分析产生莫须有的恐惧，因此...
专题公告
GWAS分析流程及可视化
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