LDSC 除了可以计算基因多效性、遗传度、遗传相关性[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQz...
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Post-GWAS：LDSC 的 Partitioned Heritability 分析
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复现一篇高分(IF = 11.274)孟德尔随机化分析文章-day1
Title: Association between Human Blood Metabolome and the Risk of Alzhei...
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复现一篇高分(IF = 11.274)孟德尔随机化分析文章-day3话不多说，直接上代码 部分结果展示 step 5. 所有SNP的F-stat值都大于10，因此都纳入分析中 step 6. 异质性检测结果 p ...
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盘点2022年孟德尔随机化高分文章
都2022年了，竟然还有孟德尔随机化能发IF > 10的文章！！！敲黑板，重点：所用数据全都是公共数据，完全可以复现！！！孟德尔随机化YYDS欢...
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，...
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TwoSampleMR：两样本孟德尔随机化孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系[https://www.jianshu.com/p/8ac31267d3d8] 主要步骤：1. 读...
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数量性状遗传性状分类 质量性状（qualitative trait）表型之间截然不同，具有质的差别，用文字描述的性状，在群体中呈间断分布。如豌豆花色，籽粒是...
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单体型分析单倍型分析理论上来说，单倍型的类别是2N，但由于LD的存在，会使得单倍型的类别远远的小于2N，但是如果当N的数目很大，即便是类别少，在整个群体中...
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GWAS位点简单进行峰拆分输出QTNs并基于GFF关联基因
来自rMVP的关联后的数据；峰拆分输出QTNsgetposQTNs.py 基于GFF关联基因，以水稻RAP注释为例（locus.gff文件；ht...
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iTOL美化系统发育树前言：我在美化进化树的时候，某站上搜了很多视频，但是都是寥寥几句带过，没有太大的实用价值，于是我下定决心要在iTOL官网学习，便摸索出了对于我自...
专题公告
群体遗传学
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