前面我们已经进行了单因素Cox回归，LASSO回归及多因素Cox回归建模，而我们想对建好的模型进行验证，本例通过内部验证组和外部验证组对Cox模...
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TCGA Cox模型-训练集、内部验证集、外部验证集综合构建Cox风险模型③
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【代码更新】单细胞分析实录(21): 非负矩阵分解(NMF)的R代码实现，只需两步，啥图都有1. 起因 之前的代码(单细胞分析实录(17): 非负矩阵分解(NMF)代码演示[https://www.jianshu.com/p/aebb5...
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miRNA与基因互作数据库
我们熟知，在特定情况下，microRNA（miRNA）可以直接或间接激活和抑制基因表达。但是，尚没有基于多组学的数据库能够证明对激活与抑制以及正...
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蛋白质组学知识背景及分析流程蛋白质组知识背景 蛋白质组(proteome)：由一个细胞、一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质，是一个整体的概念。 蛋白质组学(...
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WGCNA（2a）：一步法完成网络构建和模块检测在上一篇帖子上完成了表达量数据和表型数据的整理，这篇文章将进行网络构建和模块检测。 WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jia...
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《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 7这一章来介绍NGS的下游分析 富集分析 简单的讲，富集分析就是一种统计分析的手段，用来筛选功能相类的一组基因是否富集中差异表达的基因中。当人们拿...
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芯片数据分析流程0.安装R包 1.下载数据，提取表达矩阵和临床信息 检查数据下载的完整性看两个KB或MB大小是否一样 2.分组信息&探针注释 当一列中一部分相同...
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生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到...
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使用barcode对高通量转录组进行药物筛选
作者：童蒙编辑：angelica RNA-seq是一个用来调查药物在转录组上发生改变的有效的工具，然而单个文库的成本依然很高。使用DRUG-se...
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小鬼的WGCNA图文详解(二)--软阈值选择WGCNA分析中如何选择软阈值？这次依然还是给你抛出官网教程，依然是：你看还是不看，它就在那里，等着你的深入研究～ https://horvat...
专题公告
基本概念
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