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    SpliZ/SpliZVD | 思路新奇的scRNA-seq可变剪切指标

      基因的可变剪切造就了转录本的多样性,作为一种常见的基因表达调控机制,对于生物体的生长、发育和适应环境等方面都具有重要作用。前面写过一篇关于b...

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    2021-04-30 可变剪接与rMATS分析

    可变剪接(Alternative splicing):一个基因的外显子以不同的组合方式剪接形成不同的成熟RNA,由此产生的不同的 mRNA 可能...

    1.9 NAome 0 19
  • 可变剪切软件CASH测试

    可变剪切介绍: 什么是基因的可变剪切? 有些基因的前体mRNA(pre-mRNA)通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点)产生不同的mRNA剪接...

    2.1 尧小飞 7 25
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    sashimi plot 绘制

    我用的是ggsashimi[https://github.com/guigolab/ggsashimi#usage],这个主要是用来展示和统计局...

  • SUPPA2检测差异可变剪切

    SUPPA2原理 假设我们已经了解了可变剪切类型:传送门[https://www.jianshu.com/p/9c0f837fcab4],那么我...

  • 新的可变剪切分析软件:McSplicer

    转载自 微信公众号:茶与生信依据RNA-seq数据进行可变剪切分析的新软件:McSplicer下面对其使用步骤做一介绍: (1) 需要准备的文...

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    IsoformSwitchAnalyzeR 可变剪切分析

    曾经我用 rMATS 进行可变剪切分析,现在我觉得 IsoformSwitchAnalyzeR 更香。 IsoformSwitchAnalyze...

  • 可变剪切-微信搜狗搜索第一页

    先做个小松鼠吧,因为对可变剪切实在知之甚少,所以首先是搜狗搜索,选择前十条,做大致性理解。搜索每个大标题参考后的的内容都可以直接搜索到原文。 1...

专题公告

Alternative splicing 二代测序 三代测序