上篇Connectivity Map(cMap)的探索应用（一）中简单提及以下两种做法：一是提供了cMAP的在线分析网站：www.broad.m...
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Connectivity Map(cMap)的探索应用（二）
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肿瘤相关数据库资源汇编
Cancer-related Data Resources ArrayMap URL http://www.arraymap.org Wh...
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GO富集可视化：clusterProfiler+GOplot现在的社会正处于大数据时代，生物学研究领域也迎来了大组学时代。无论是植物。动物，还是微生物，都有许多物种被测序。在后续的个性化分析过程中，通常会...
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分享一篇GSEA分析文章，理解GSEA与常用通路分析区别
今天经人提醒才发现自己对GSEA的理解完全错误，也怪自己没认真看文献和资料。重点理解： 一般的差异分析（GO和Pathway）往往侧重于比较两组...
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GEO数据挖掘小尝试：（三）利用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包，可以用来做各种富集分析，如GO、KEGG、DO（Disease Ontology a...
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GEO数据挖掘小尝试：（一）寻找共同差异基因在使用Bioconductor 分析芯片数据（一）中我们使用的是芯片的原始数据（即*.cel文件）进行分析，但在大部分情况下我们是可以利用GEO...
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GEO数据挖掘小尝试：（二）蛋白质互作网络分析在上一篇文章《GEO数据挖掘：（一）寻找共同差异基因》中我们通过两个实验的数据寻找到了一些差异基因，本篇文章将对这些差异基因的互作关系进行简单的...
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Week23 — WGCNA分析+公共数据库挖掘你感兴趣的癌症第23周 2018 — 10.21-10.27 原文链接: Application of weighted gene co-expression...
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基因表达分析
基因表达检测方法 基因表达需要直接或者间接测量某个生物个体内全部基因的转录产物（指狭义的转录组即mRNA）在细胞中的丰度，常用的检测方法有：实时...
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GEO在线分析工具
打开方式？ 可以在NCBI中打开，有geo datasets 和 geo profiles两种；也可以直接搜索geo打开 geo有哪些数据？ g...
专题公告
GEO数据库介绍，数据处理流程
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