MACS的自述文件（2.1.2） 运行 结果 介绍 随着测序技术的改进，染色质免疫沉淀，然后进行高通量测序（ChIP-Seq）越来越受欢迎研究全...
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ATAC-seq 分析流程入门ATAC-seq 全称是 Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throu...
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基因家族分析四(绘制基因家族motif图)一：搜索其他保守蛋白结构域 需要准备的文件有：NBS蛋白序列，TIR.hmm和RPW8.hmm 二：拟南芥NPS基因家族含有哪些motif 识别...
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Fimo扫描基因组序列在做motif分析时，经常用Fimo扫描基因组序列得到motif对应的序列位置，进而进行下一步的分析。说明文档可参考：http://meme-s...
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处理NGS的新神器systemPipeR首先附上软件链接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemP...
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第7篇：用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化上一步骤（第6篇：重复样本的处理——IDR）用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估，同时得到了merge后的一致性的peaks——sam...
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转录因子详细介绍(motif)TF: transcription factor转录因子TFBS: transcription factor binding site转录因子结...
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ATAC-seq分析干货-1
作者 | Arno审稿 | 童蒙编辑 | amethyst ATAC-seq技术由于其要求细胞量少，实验简单、快速、高效且应用范围广，是近年来转...
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ATAC-seq分析干货-2
作者 | Arno审稿 | 童蒙编辑 | amethyst 上一期我们介绍了ATAC-seq相关的背景知识。ATAC-Seq能帮助我们从全基因组...
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MACS2为ATAC-seq callpeak
ATAC-seq作为检测基因组开放位置的重要手段，被越来越多的使用。而其call peak的方法也有很多，这里我们介绍的是MACS。MACS最初...
专题公告
你是个什么seq
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