以下代码用于SLURM调配系统的服务器递交任务如果在个人电脑上的注意安装PEER软件，并配置环境变量，使用R代码部分不能照抄，需要调整代码 Co...
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RNA-seq多Run合并、VST标准化、PCA、差异分析
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单细胞转录组测序---多样本整合分析完整代码
最近做了天然胸腺单细胞测序结果的分析，我在GEO数据库中下载了10个样本（GSE182135），完整的的代码如下，做一个记录，还在摸索阶段，如果...
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跨物种RNA-seq标准化及差异表达前言 对跨物种的RNA-seq进行标准化和差异分析已知是一个问题，而目前对此类问题的相关研究还比较少，有用RPKM进行各物种之间标准化的，也有基...
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KEGGresults OR Enrichresults 结果导入cytoscape绘制基因通路网络图用到了这个需求，找教程的时候，其实也找到了比如这个 (1 封私信) Cytoscape整合GO富集分析和表达结果 - 知乎 (zhihu.com...
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Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作图！featureCounts是一个用来统计count数的软件，运行的速度飞快，比之前用的htseq-count快了好多好多。 照例先说一下怎么下载...
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转录组全新学习之总篇
Y叔的RNA-seq workflow 强力推荐[https://github.com/twbattaglia/RNAseq-workflow]...
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【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合主要内容： 1.多组学数据整合概述 2.主要分析软件汇总 3.数据预处理的方法 1.多组学数据整合概述 1.1多组学数据整合的现实意义 在研究...
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转录组分析：RNA-seq pipeline through kallisto or salmon
RNA-seq pipeline through kallisto or salmon kallisto 和salmon相比含有hisat2和S...
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超有诚意的R语言数据读取指南
2020-2-23 更新：import 输入其他格式的数据报错的问题，可用参数format 解决，例如format = "\t"。帮助文档中该参...
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kallisto比对参考转录组kallisto是2016年发表在Nature Biotechnology上的一个比对工具，可以将bulk或者single-cell RNA-S...
专题公告
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