写在前面 时间拨回去 2015年，那时我接触生信已有一年，TBtools 开发尚在萌芽阶段。那会，我写了几款小的软件，包括 “blast3go”...
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点点点 | 真香！Simple GO GSEA 富集分析 ~ -
GRO-seq 分析GRO-seq 分析 第一篇就以最近做过的GRO-seq分析为例来展开吧。 GRO-seq的原理和用处 GRO-seq 全称 Global ru...
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了解和绘制火山图师弟：师兄，火山图怎么得到的？我都快愁死了......师兄：你不是学过R语言吗？师弟：道理倒是都懂，看书归看书，但是实际应用起来大脑就一片空白，...
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基因注释
前情提要 搞NGS，注释文件是我们经常需要用到的。但是不同的实验室偏爱的数据库各不相同，甚至同一个课题组的小伙伴都会选择不同来源的数据库。那么不...
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高通量测序数据处理学习记录（一）：比对软件STAR的使用high-throughput seq analysis急先锋——STAR的使用介绍 在所有物是人非的景色里，我最中意你。 正体 这次给大家带来...
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转录组分析 | 使用STAR进行比对
欢迎关注微信公众号“生信小王子”！ 前几期，小编已经教大家完成了RNA-seq数据的质控，下面就要正式开始转录组分析啦！ 通过二代测序我们可以获...
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【原创】R语言实战：read counts如何转化为TPM和FPKM, TPM和FPKM相互转化
载入数据 mycounts<-read.csv("2020武汉加油.csv")head(mycounts)rownames(mycounts)<...
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NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效...
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归纳:RNA-seq去重前言 我们知道二代RNA-seq这个过程中会经过PCR扩增,但是PCR具有偏好性,这样就导致了有点序列扩增的多,有的少.在总扩增倍数相同的基础上...
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如何构建表达矩阵——RNAseq中游分析
中游分析这个词是我杜撰的，用来强调表达矩阵构建过程并不简单。 0 前言 前几天Jimmy老师发了一篇 我用这个技能一杯咖啡的功夫就挣了800块钱...
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