论文 GENESPACE: syntenic pan-genome annotations for eukaryotes https://www...

前几天，实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析，没想到却在多序列...

多倍化以及后续的基因丢失和二倍化现象存在于大部分的物种中, 是物种进化的重要动力。如果一个物种在演化过程中发生过多倍化，那么在基因组上就会存在一...

最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送，发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念，前者主要...

参考文章：https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[htt...

共线性分析 作为王希胤老师课题组的学生，共线性相关分析上，一直没有提出更方便或深刻的方法，着实有点儿惭愧。王老师是共线性分析软件Colinear...

orthovenn2[https://orthovenn2.bioinfotoolkits.net/home]image.png 点击start...

写在前面 Emmm，前面推送了几期好基友-比较基因组小王子的 WGDI 软件使用和比较基因组图表解读。后台常常受到消息，大体意思“快更新！”。原...

前言 点阵图（dotplot）作为比较基因组最基础的分析，常用的分析软件有JCVI、mummer等，这里介绍一种新的点阵图方法，即WGDI画点阵...