RNA-seq(7) : DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)[https://www.jianshu.com/p/3a0e1e...

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0.清空环境,加载R包 1.GO 富集分析 (1)输入数据 (2)富集 (3)可视化 条带图 气泡图 (3)展示top通路的共同基因,要放大看。...
做生物学研究的人,难免会遇到各种各样的基因ID号。有我们比较熟悉的也比较直观的基因名字,如TP53。也有其他数据库里,但是也比较常用的ID,如e...
大多数人应该不是中科院预警就行,部分期刊可能是吉大一院预警。 bmc cancer, Cancer Medicine, Frontiers in...
下面这张图大家应该常见吧 一张图的局部放大,我们来实现一下, 示例数据 开始画图,先画散点图 好,开始局部放大 最后我们修改主题和风格 当然,可...
做差异分析需要的数据:表达矩阵和分组信息TCGA的数据只要表达矩阵就够了,因为其TCGA的样本ID比较特殊,样本ID的第14和15位是>=10还...
首先调取Xena网页的TCGA数据做Cox生存分析,数据可以通过hiplot官网自主研发的ucsc-xena-shiny直接在线获取访问http...
TIP--Tracking Tumor Immunophenotype (http://biocc.hrbmu.edu.cn/TIP/) 接下来...
在上次的文章[https://zhuanlan.zhihu.com/p/348449824]中我们给大家分享了细菌对抗生素产生耐药性的机制,先来...
由reads count数计算TPM 和FPKM下载gff文件http://venanciogroup.uenf.br/cgi-bin/gmax...