单细胞学习入门教程，里面的东西可以反复琢磨，标准分析基本上就这么多内容。教程中提到了大量的资源介绍，参数含义解读，甚至高级部分的简洁版算法介绍，...
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Seurat包------标准流程 -
TCGA数据下载和整理的三种方法TCGA数据下载方法：gdc-client，Xena和gdcRNAtools 需要下载的数据组学信息（样本）：（存储单个病人表达数据，需整理为表...
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让TCGA表达矩阵和临床信息方便的匹配
0.背景 关于样本id和分组信息：TCGA的样本id里藏着分组信息[https://mp.weixin.qq.com/s/UohDh5fHkTP...
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从TCGA数据库下载并整合清洗高通量肿瘤表达谱-临床性状数据测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序...
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readmaf读取样本名报错一、isTCGA是个什么参数，到底什么时候加？ 首先，对读取gz格式还是txt格式没有啥特别要求 二、但是读取后，样本名称有显著改变，即samp...
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TCGA数据挖掘笔记1生信技能树2021数据挖掘线上课笔记，需要结合课程讲解服用 TCGA下载数据的方法-gdc-client（软件名）：需要写命令运行，官方下载的数...
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再做GO+KEGG+GSEA1、再做GO 代码如下 文章里面是做了生物过程和细胞 的两种分析。 2、再做KEGG分析 代码如下： input：但是没有红蓝色的标点。 所以我...
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肿瘤研究不能不知道的TCGA数据库挖掘工具大全，TCGA再也不愁TCGA数据库的挖掘工具层出不穷，从数据下载到数据挖掘，这里小编给大家整理一份官网的数据挖掘工具大全： 广而告之 说一个事，鉴于简书平台在信息传...
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TCGA数据库挖掘（1）TCGA准备TCGA workfolw RMD格式 R包安装 数据下载 文件类型介绍 manifest xml counts 本文的内容是用GDC下载并整理...
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数据分析
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