STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?...
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VCF (variant callformat) 文件记录了所有样品基因组中所有位置变异(主要包括SNP和InDel)信息。后续几乎所有分析内容...
目前热门的单体型基因组组装,以下内容来源于安诺的单体型基因组组装新品发布会单体型也称为单倍型。二倍体有两套染色体单体,一套来自父本,一套来自母本...
组学工具合集 整理了一些目前知道的与组学相关的工具,可能不全面,欢迎补充 基因组学 一代组装 Celera Assembler: 最具代表性的工...
最好的文档其实还是官方文档。。。http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/...
DSS是一个可用于做RNA-seq差异表达分析或甲基化差异分析的R包,在做差异甲基化分析时,DSS对每个CpG进行统计检验,然后根据我们指定的阈...
废话不多说,直接简单粗暴的开始吧 导入基因组 导入基因组文件:Genomes→load geome from file→选择"reference...
fastp是一款较新的数据质控软件,接触这个软件也是由于目前市场的软件各有功能但是功能都不是很全,譬如最近接触到一个RNAseq数据,质量较差,...
基本概念 相似性(similarity) 一种很直接的数量关系,比如部分相同或相似的百分比或其他一些合适的度量 如:A序列和B序列的相似性是80...
导读 用query基因、DNA序列、16S扩增子序列、蛋白序列比对基因注释、物种注释 、基因功能注释数据库。Blast准确性高,速度慢。Diam...