写在写在前面的前面 我不喜欢调用外部程序，如果是简单的事情。我觉得应该用最简单的方式来实现。如果你只是想画一个简单的Circos图，perl？不...
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任何人！十分钟掌握Circos图绘制
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使用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包，看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档，加上了我的测试...
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bcftools常用命令详解http://samtools.github.io/bcftools/bcftools.html https://www.biostars.or...
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Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的区别1. 为什么我们要进行Normalization 测序深度：某些低表达量的基因只有在较高的测序深度时才能检测到。一般而言，随着测序深度的增加，基...
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使用HINT-ATAC进行ATAC-Seq的footprinting分析关于ATAC-seq分析，在网上看到两篇关于同一片综述的翻译，写的很好：ATAC-seq数据分析工具的比较和推荐（Genome Biology综...
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转录因子详细介绍(motif)TF: transcription factor转录因子TFBS: transcription factor binding site转录因子结...
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GSE83521/GSE89143去除批次效应老大在群里出的题，说感觉这个热图很诡异，然后中间我自己没有用boxplot查看数据的表达量，对于数据不能有正确的认识，导致一开始的deg的log...
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RNA-seq数据的基因共表达网络分析刘小泽写于18.10.24最近开始写第一篇英文小论文，练练手，为将来写英文大论文做准备 目录 1 背景 Background Types of ...
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conda的安装与使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信软件都可以通过conda安装，省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件，conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问...
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富集分析不光有条带图和点图，还有...参考资料 南方医科大学网红博导Y叔的一本神奇的书https://yulab-smu.github.io/clusterProfiler-book...
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