许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些教程介绍如何用PAML进行分析...
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计算分子进化-搞懂PAML的正选择分析 -
选择压力分析，从序列下载到结果绘图选择压力及基因在进化过程中所受到的压力，也称自然选择。 在遗传学中， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率（Ks...
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Ks分布密度曲线图添加峰值线和峰值
加载所需的R包 设置工作路径 提取不同类型的数据 定义一个寻找密度图峰值的函数 限定取值范围 获得峰值 使用ggplot2绘图 Find the...
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PAML-discussion-groupHi PAML Users,Welcome to the PAML discussion group. This site is for po...
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KaKs_Calculator2.0 做ka/ks过程的一点记录KaKs_Calculator使用中需要用到axt格式的比对文件，在KaKs_Calculator的文件夹中自带一个生成axt格式文件的脚本，A...
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paml计算dn/ds的小实例更新：20190319 使用EasyCodeML完成dnds的计算，自己尝试了分支模型和位点模型的计算，简直不要太容易！ 更新：20190314...
专题公告
选择压力分析好文
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