在上一篇中，本来说好的是“如何提取拟南芥（或非模式物种）基因的启动子序列_基于R”，结果却只说了提取拟南芥的情况。 这里我再补充下针对非模式物种...
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如何提取拟南芥（或非模式物种）基因的启动子序列_基于R_补充部分（getSeq或BSgenome）
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Hi-C技术的初步了解最近的一次组会上看到实验室的同学汇报的结果里有Hi-C的图，所以我就悄咪咪的去了解了一下Hi-C技术的原理。整理一下。 Q1: Hi-C的全称是...
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多组学分析及可视化R包最近打算开始写一个多组学（包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组）关联分析的R包，避免重复造轮子，在开始之前随便在网上调研了下目前已有的R...
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GWAS基本概念文章来自：Concepts and relevance of genome-wide association studies 我觉得读完这篇文章...
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HOMER中findMotifGenome.pl中碰到的两个小错误
我有时候会对DIffBind的输出结果进行下修改，然后放到HOMER里面去找motif。但我有个不太好的一点就是，每次都不记我的awk操作，导致...
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好用的小工具及数据库资料做富集分析的网页工具https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost用法：把基因列表输入就可以了, 如果基因的重要性有区...
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count normalization的代码
在前面的count normalization的方法部分，我初步介绍了一些常见的count normalization的方法，这部分我会写出对应...
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Intervene: BED文件的intersect和绘制韦恩图一、背景介绍 通常，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和统计：...
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ATAC-seq分析干货-2
作者 | Arno审稿 | 童蒙编辑 | amethyst 上一期我们介绍了ATAC-seq相关的背景知识。ATAC-Seq能帮助我们从全基因组...
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RNA-seq实战分析流程
一、下载测序数据 ①SRA数据库[存储二代测序的原始数据]②在进行上游分析时，数据格式转换过程概述如下：sra↓FASTQ↓bam↓counts...
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