之前写过一篇细胞类型注释的推文:单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释[https://www.jianshu.com/p/1887...

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有一个朋友问了我一个问题,DESeq2的baseMean是如何计算?我最初都是认为baseMean计算的是对照组的样本标准化counts的均值。...
ceRNA 最近被玩的很多,构建的方法很多,这个是我这几天探索觉得比较好用也比较省力的,分享给大家。我已经把代码 数据 文件打包好了,在生信星球...
随着对人类疾病和生物过程的研究,从实验测序产生了大量的功能性lncRNA集合。虽然目前已开发多个lncRNA数据库/分析工具,但现有工具仍存在l...
在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的Ad...
从读取表达矩阵到建立seurat对象都在服务器上进行(文件太大)建立Seurat对象后,save.image,之后转移到电脑上操作。读取表达矩阵...
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