之前写过一篇细胞类型注释的推文：单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释[https://www.jianshu.com/p/1887...
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单细胞分析实录(14): 细胞类型注释的另一种思路 — CellID
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DESeq2的baseMean和log2FoldChange是如何得到的？
有一个朋友问了我一个问题，DESeq2的baseMean是如何计算？我最初都是认为baseMean计算的是对照组的样本标准化counts的均值。...
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从mRNA到ceRNA networkceRNA 最近被玩的很多，构建的方法很多，这个是我这几天探索觉得比较好用也比较省力的，分享给大家。我已经把代码 数据 文件打包好了，在生信星球...
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做lncRNA富集分析，你需要它：lncSEA
随着对人类疾病和生物过程的研究，从实验测序产生了大量的功能性lncRNA集合。虽然目前已开发多个lncRNA数据库/分析工具，但现有工具仍存在l...
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Seurat的打分函数AddMouduleScore在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的Ad...
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单细胞实战1:两样本合并从读取表达矩阵到建立seurat对象都在服务器上进行（文件太大）建立Seurat对象后，save.image，之后转移到电脑上操作。读取表达矩阵...
专题公告
收录单细胞分析方法及软件
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