刘小泽写于2020.5.29这篇文章做了一件事，就是帮助我们区分不同的批次矫正方法，然后比较了一下优劣 文章题目：Flexible compar...
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小泽看文献 | 用BatchBench比较scRNA批次矫正方法 -
monocle2 拟时间分支点分析结果解读How to map cell fate to branches? 拟时间分析结果有很多重要的结果，但是这些结果如何解读？比如下图的分支点分析结...
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桑基图在单细胞数据探索中的应用什么是桑基图 桑基图（Sankey diagram），即桑基能量分流图，也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数...
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复现原文（一）：Single-cell RNA sequencing of human kidney（step by step）
https://www.nature.com/articles/s41597-019-0351-8 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （...
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让你的单细胞数据动起来！|iCellR(二)
前情回顾：让你的单细胞数据动起来！|iCellR(一)在上文我们已经基本完成了聚类分析和细胞在不同条件下的比例分析，下面继续开始啦，让你看看iC...
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2019文献汇总 | 单细胞与病毒感染
我的单细胞测序project主要是做炎症相关的单细胞转录分析，在检索paper的过程中，发现有关单细胞测序和病毒相关的文献是很少的，大致统计一下...
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【单细胞入门必读】单细胞RNA-seq技术和数据分析简介
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis...
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Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder0. 简介 这篇文章是2019年发表在Nature Communications上的使用自编码器对单细胞RNA-Seq数据进行降噪的工作，通讯作...
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第10周-单细胞看小鼠肝脏发育
单细胞看小鼠肝脏发育 肝脏背景知识 肝脏是一种多倍体器官，由具有一个或两个细胞核的肝细胞组成，每个细胞核含有2,4,8或更多单倍体染色体组。 肝...
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10X cellranger 报错解决办法越来越多的同学开始自己尝试做10X单细胞转录组数据分析了，除了Linux的基本命令之外，首先用到的软件是cellranger。失败是成功之母，对...
专题公告
scRNA-seq学习笔记
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