首先得到每条序列的长度，在这里使用seqkit软件。seqkit软件是一个强大的序列处理工具，安装方法参见官方网站.代码如下： 结果如下所示： ...
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fasta/fastq序列长度分布统计 -
R包clusterProfiler: 转换ID、GO/KEGG富集分析参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemb...
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强强联合的基因ID转换刘小泽写于2020.5.28Ensemble转Symbol其实不是这么简单，问题百出，需要留意 0 今天遇到一个需求，先来看看 有这样的四个文件...
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用Python和C语言实现DNA双序列局部比对（Smith-waterman算法）双序列局部比对的算法和全局比对算法的步骤相似，只是赋值规则稍有不同，每个单元格的分值由前面对角线的分值和引入一个空位得到的分值的最大值决定，但是...
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Deep-learning augmented RNA-seq analysis of transcript splicing0. 简介 这篇文章是发表在Nature Methods上的使用深度学习来扩充可变剪切的分析。通讯作者是来自于UCLA的邢毅老师。这篇文章创新点...
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SNP功能注释网站合集这篇文章是对SNP位点功能注释在线网站的一个总结帖。 软件排名不分先后，优先顺序可以看推荐指数。 彩蛋在最后，请坚持看完 1、GWAS4D, 推...
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R：堆叠图、冲积图、分组分面、面积图导读 宏基因组分析分为物种分析和功能分析两大块。物种组成分析是物种分析中最基本最常见的分析方法。利用R语言堆叠图，我们可以将一个项目中所有样品的...
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Super useful!! #实用的单行命令合集
周末闲着无聊在推特上闲逛，刷着刷着发现了Ming Tang大神的一条推文。他将他日常经常使用的单行命令整理到其Github中，然后分享给各位推友...
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简单小需求：如何将FPKM转换成TPM？
刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析，得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性，推荐使用TPM。 ...
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如何快速自学生物信息学为了不让大家再走我之前自学生信时候踩过的坑，走过的弯路，将一些比较重要的入门书籍，网站和后续的学习渠道总结如下，供大家参考。 目录 统计学 系统...
专题公告
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