cirRNA是非编码RNA中的一大类,它由一种非经典剪接方式——反向剪接(backsplicing)产生;当反向剪接发生时,下游剪接位点与上游剪...
cirRNA是非编码RNA中的一大类,它由一种非经典剪接方式——反向剪接(backsplicing)产生;当反向剪接发生时,下游剪接位点与上游剪...
通过spliced reads的mapping能发现线性RNA和环状RNA的剪切方式不同。一个是正常的5’/3’前后剪切,一个是反向的5’/3’...
Find_circ工具是最早利用高通量测序数据预测环状RNA的开山鼻祖。该工具是Memczak等人2013年在权威Nature杂志上发表题为“C...
circRNA的生信分析根据鉴定的方法不同可以分为以下两种: split-alignment-based approaches:针对内含子驱动模...
环形RNA是一类在真核生物中广泛存在的具有特殊环状结构的非编码RNA分子。已有文献表明,在生物体内,环形RNA有着miRNA海绵、RBP海绵以及...
看了一圈,好像没有环状RNA分析的下游 CircRNAprofiler 是一个基于 R 的框架,只需要 R 安装,并提供15个模块,用于对 ci...
周一小编为大家分享了一篇circRNA理论知识点的paper(👉circRNA在癌症和肿瘤学中的新作用[http://mp.weixin.qq....
今天测试另一个环状RNA预测的重要软件——CIRCexplorer2。该软件是由中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究...
随着对人类疾病和生物过程的研究,从实验测序产生了大量的功能性lncRNA集合。虽然目前已开发多个lncRNA数据库/分析工具,但现有工具仍存在l...
前言:这个帖子本应该在2018年就要写完的,有个网友甚至当时加了我微信给了50块钱我都没有给他一个代码版。在这里希望这个网友能看到,对得起你的5...
专题公告
ceRNA network mirna mrna lncrna circrna psudogene