随机误差随着数据量增加而减少，系统误差随着数据量增大而增大。常见的系统误差包括三种:第一种是序列组成异质性(compositional hete...
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系统发育关系:系统误差
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密码子使用偏性的分析方法介绍DNA通过转录，控制着mRNA的合成，而mRNA是蛋白质合成的模板，它决定了蛋白质的序列结构、功能等信息。把mRNA看作一种语言，它由4种不同碱...
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使用MrBayes构建贝叶斯系统发育树建树是分子系统发育与进化研究中绕不过去的一道坎，本文就本人实际经验介绍贝叶斯树的实际操作： 基于不同原理的系统发育树构建方法的比较 Bayesi...
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SNP数据构建系统进化树大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了，接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日，干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法...
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三种方法构建系统发育树 学习笔记
所用数据为一个属内不同种不同群体的叶绿体基因组序列，数量为80条。 发现用全长序列建树的时候，不适合选用太多外类群，否则ML法中会导致属内分枝的...
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MrBayes使用2021-07-30
使用MrBayes需要配置Nexus 文件参考https://bin-ye.com/post/2019/10/19/%E5%A5%BD%E5%A...
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MrBayes安装linux系统下2021-07-29MrBayes: Bayesian Inference of Phylogeny 官网：http://nbisweden.github.io/M...
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用MrBayes构建系统发育树操作步骤整理总结
最近在学习构建进化树，尝试了用PHYML构建ML树和用MrBayes构建贝叶斯树，因为构建ML树时用的是网站的PHYML进行的，操作简便，所以就...
专题公告
系统发育分析所用的软件，方法，原理等
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