前面由于对miRNA的探针数目没有正确的理解，以为数据一直没有下载完全，折腾了一番。后来经老大jimmy提醒了，miRNA有2000左右的探针就...
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一篇WGCNA文章复现-GSE85589-下集
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bilibili视频-《生信人应该这样学R语言》-P13-R语言作业-中级R语言小作业-中级 1.请根据R包org.Hs.eg.db找到下面ensembl 基因ID 对应的基因名(symbol) ENSG0000000...
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非常详细的GEO数据下载和清理，你要看吗-GSE33532
来自数据集GSE33532,对于第一步获得表达矩阵，做了还蛮详尽的注解过程，希望能对其他人有帮助。虽然看上去全是黑色代码快，但注解理解示例全在这...
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公共数据库没有错误吗？我们对GSE17215进行分析 按照原数据3X3分组 1.注释基因，整理数据 2.检查数据 发现按照3X3分组样本主成分和聚类，有一个样本表现很...
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典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集
典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - 数据获取到标准化介绍了实验的设计、数据获取、数据标准化和注释，下面是如何利用L...
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R语言GEO数据挖掘02-解决GEO数据中的多个探针对应一个基因解决GEO数据中的多个探针对应一个基因 当我们来到这一步时我们默认经过前期的处理，你已经获得了表达矩阵的数据，获得了探针的注释信息。在进一步探索...
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GEO数据挖掘系列文-生信技能树
GEO数据挖掘系列文-第一期-胶质母细胞瘤http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTEwODk0Ng==&mi...
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1.Start-GEO下面这个是在关于在要下载安装包之前做的切换镜像,搜索到http和https有什么区别 一、HTTP和HTTPS的基本概念HTTP：是互联网上应用...
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公共数据库挖掘之利用R语言下载并整理GEO数据因为是初次利用R包进行下载数据，其中遇到了各种问题，重装了几个R，终于可以顺利下载文件了。现在把过程整理总结如下，其中有问题的地方还希望大家一起...
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GEO数据挖掘小尝试：（一）寻找共同差异基因在使用Bioconductor 分析芯片数据（一）中我们使用的是芯片的原始数据（即*.cel文件）进行分析，但在大部分情况下我们是可以利用GEO...
专题公告
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