学习一篇NC的单细胞文章(一):质控[https://www.jianshu.com/p/98437c8f86f7]学习一篇NC的单细胞文章(二...
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我们昨日进行clustering之后,将1107个细胞分成了9个簇,今天学习tsne方面的知识。 Fig1.c: 可以看到,病人样本之间的细胞类...
很开心能在2020年加入“单细胞天地”这个团队,作为单细胞新手,我希望未来能学会更多的单细胞测序知识,写更多的笔记,撸起袖子干呗!最近看到了20...
我们这次直接拿GSE118390上已经normalized 的数据进行下游分析。首先我们先看看文献的这张复杂热图,哈哈,这张热图画得真是好看。左...
我们开始看看作者是怎么标准化数据的。考虑到各种混杂因素对单个细胞中定量表达水平的影响,混杂因素包括dropout events的频率、单个细胞中...
我们上次基于各种marker对1189个细胞进行分类,然而,仅基于marker对细胞进行分类可能是不精确的,特别是考虑到scRNA-seq数据的...
在ggplot2程序包的加持下,R语言可以做出非常漂亮的统计图出来。然而大家是否会有这样的体会,为了做出理想的图片,需要不停的调整作图的参数,包...
最近有朋友问怎么给地图上用饼图添加采样信息,本节就来介绍一下,满满的都是细节 下载并加载R包 获取地图信息 构建需要展示的国家数据 结合采样信息...
今天的推文来自于公众号读者的投稿,作者 RGzxs,编辑排版由 小明 完成。 下面是正文 前几天看了几篇闫大佬绘制的中国沿海地区的地图(公众号:...
aplot Y叔开发,拼图解决坐标对齐的问题 extrafont 解决ggplot2绘图导出pdf文件中文字体乱码的问题 对应的B站介绍视频ht...
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