autoprokka.py这个Python脚本可以方便地批量地使用prokka去进行注释，自动按照输入文件名去命名输出文件，并且每个样本单独一个...
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autoprokka:使用prokka批量注释
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【动植物研究动态】20220815文献解读
Hortic Res | 武汉大学李家儒：盾叶薯蓣高质量基因组解析与薯蓣皂苷生物合成进化[https://mp.weixin.qq.com/s/...
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对生成的bin进行合并、注释、评估
四个环境gtdbtk、pangenome、minigraph、drep、metawrap-env gtdbtk可以对所有bin进行注释，可以看...
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人类泛基因组草图发布近日，人类泛基因组参考联盟（HPRC）在《Nature》杂志上发表了《人类泛基因组草图》。相较于我们常用的GRCh37、GRh38 等线性参考基...
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比较基因组学在细菌基因组中的应用
更多案例分享： 基因组测序在细菌基因组中的应用[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weix...
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利用泛基因组挖掘目标细菌的靶标基因-Roary,gbksplit和TBtools准备 1.基因组序列下载与注释，使用prokka进行注释，获得gff文件。参考我前一篇：autoprokka:使用prokka批量注释 - 简书...
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“人类泛基因组项目”-将人类的遗传变异一网打尽！（转）
研究人员正在创建一个体现全人类基因变化的人类“泛基因组”，然而不是每个人都想参与。 几年前，美国华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler彻底...
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文献导读：小立碗藓三维发育的细胞特异性转录组分析在上一篇导读中提到，目前在做小立碗藓的单细胞测序，相关的maker gene已经能发掘到很多，还缺少转型期相关的maker gene，看到了20...
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国家基因组科学数据中心（NGDC）---组学原始数据如何上传GSA前言 在发表文章之前我们需要将测序的原始数据上传到一个公共库，并在文中提供accession number，实现数据的公开共享，这是国际惯例。以...
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公共数据库+泛癌分析，全基因组DNA甲基化相关也能轻松6分+Genome-wide DNA methylation profiling and identification of potential pa...
专题公告
泛基因组+构建+比对+结构变异+……
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