前言 最近接触到ROC曲线相关的问题，因此下面整理出相关的文章，记录相关原理和应用。 数据分析最让人着迷的一种用途是可以基于现有数据创建能够区分...

MicroRNA (miRNA) 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小 RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个 miRNA 可...

0.缘起 很多文章中用到GEPIA这个网页工具来进行TCGA和GTEx表达量的联合比较，但在此之前我不知道要怎样在R语言中实现。​这个GEPIA...

之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数据的分析过程。 参考文章：1....

背景 查看某些基因在特定癌症里是不是发生了拷贝数变异。 最简单的方法 直接去一些分析网站上查看，当然也有一些弊端，例如数据更新滞后，没有给出明确...

下载TCGA数据的方法有很多，上一篇介绍了如何用gdc-client批量下载数据，基于网上有很多用TCGAbiolinks包下载数据的教程，所以...

前言 很多时候，我们分析完差异表达基因后，发现会得到一大堆差异基因，常见的做法有降低Pvalue的阈值，挑选fold-change最大的基因，做...