在上一篇文章中，分享了有关基因组Phasing的原理，一共有三种，分别是：家系关系分型(Related individuals Phasing)...
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如何使用Shapeit2对人类基因组数据进行Phasing -
【测序实验】二代测序文库读长的影响因素-实验角度简介二代测序文库读长的影响因素-实验角度简介 一、现市场上，常见的文库长度种类1)life的Ion Torrent平台：该平台主要用于临床快速检测、...
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建库测序若干问题（2）测序错误率
转自 https://yangguang8112.github.io/2017/03/09/%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E9%94%9...
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建库测序中的若干问题（1）转自 http://www.biodiscover.com/news/research/732481.html 文库结构可分为以下几个部分：插入...
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测序中加入Phix的作用
转自http://www.zxzyl.com/archives/789 测序中加入Phix的作用 测序建库的时候，会加入一定比例的Phix，那么...
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人类基因组的Phasing原理是什么？什么是Phasing？ Phasing，或者说Genotype Phasing，它的中文名有很多：基因定相、基因分型、单倍体分型、单倍体构建等在...
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样本量重要，还是测序深度重要? 生物信息工程师可以分为多少种类型? |《解螺旋技术交流圈》精华第3期今天，继续把发在“解螺旋技术交流圈”的部分主题整理出来，分享给你。 1. 请问对于同一份BAM文件使用samtools depth和用samto...
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GATK4全基因组数据分析最佳实践,我以这篇文章为标志,终结当前WGS系列数据分析的流程主体问题 | 完全代码这是我根据之前的WGS系列和GATK4实践文章进行重新梳理之后确定下来的分析流程，这是一个WGS的最佳实践，它基于GATK4和我的实际经验，稍作...
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人参考基因组不同版本区别 CRCH37 vs b37 vs hg19 vs hsd537 vs GRCH38
NCBI对应UCSC，对应ENSEMBL数据库：GRCh36 (hg18): ENSEMBL release_52.GRCh37 (hg19):...
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从零开始完整学习全基因组测序（WGS）数据分析：第2节 FASTA和FASTQ在WGS数据的分析过程中，我们会接触到许多生物信息学/基因组学领域所特有的数据文件和它们特殊的格式，在这一节中将要介绍的FASTA和FASTQ便...
专题公告
WGS, WES, target sequencing
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