关于为何要进行SNP的过滤： 第一，低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果，甚至影响后续对生物学问题的解释；第二，群体研究...
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SNP过滤时常用参数的解析（群体遗传） -
基因型填充(Genotype-Imputation)：从原理到操作移步 github 实现目录跳转，获得更好的阅读体验 目录 基因型填充1.1. 问题描述1.2. 技术来源的基因型缺失1.3. 缺失的判断：缺失...
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GWAS--基本概念(未完待续...)全基因组关联分析 GWAS (Genome-wide association study) 应用基因组中数以百万计的单核苷酸多态；SNP为分子遗...
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GWAS写在前面：本文为自己在学习过程中看过各类资料后整理做的笔记，纯属方便自己学习以及后期回顾，也希望有幸能帮助到和我一样的小白们，各位大神如果发现有...
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全基因组关联分析 (GWAS) - 简介在硕士就读期间，就已经做过 GWAS 相关的分析。当时标记量非常少， windows 系统分析就足够了，作图方面涉及的脚本也基本是蔡师兄帮写的。...
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GWAS imputationGWAS imputation是什么？ Genotype imputation 是运用连锁不平衡的原理依据一个高密度的参考基因组填补要研究数据的...
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关于全基因组关联分析（GWAS）
全基因组关联分析是一种在人类或动植物全基因组中寻找变异序列的方法，全英文名为Genome-wide association study，缩写名为...
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全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析（GWAS）原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得，做这个分析，先从跑流程开始，再去看原理。 为什么...
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VCF格式刘小泽写于18.7.17所有的数据，一旦要找变异位点信息，就离不开VCF。豆豆也是在写一个重测序的操作流程，遇到了VCF文本，之前也是没有了解过...
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玉米全基因关联分析 ( GWAS Analysis Pipeline )全基因组关联分析是基于数量性状连锁不平衡理论，通过表型与基因型关联分析获得影响表型性状的显著关联标记。 1. 软件 Tassel / Gaipt...
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