关于ATAC-seq分析，在网上看到两篇关于同一片综述的翻译，写的很好：ATAC-seq数据分析工具的比较和推荐（Genome Biology综...
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使用HINT-ATAC进行ATAC-Seq的footprinting分析 -
ATAC-seq入门ATAC-seq全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughpu...
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第5篇：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（二）——ChIPQC1. 学习目标 讨论ChIP-seq数据质量评估的其他方法 用ChIPQC产生质量统计报告 鉴定低质量数据的来源概览图Additional Qu...
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DiffBind分析ATAC-seq（差异peaks）
最近遇到一个问题，用DiffBind找差异peaks，但是网上没有找到合适（直接用）的参考，网上的例子[https://www.jianshu....
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ATAC-seq 建库Tn5转座酶结构 Tn5转座子由编码三个抗性基因的核心序列（kan、ble、str）和两条倒置的IS50序列组成，其中IS50R和IS50L的序...
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ATACseq 分析流程ATACseq 基本原理如下图所示。真核生物 DNA 与核小体结合形成染色质，结合的紧密程度是动态变化的。当 DNA 需要复制或转录时，结合变得...
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ATAC-seq分析：Motifs分析（11）1. 切割位点 ATACseq 应该在较小的保护区（如转录因子结合位点）周围生成较短的片段（我们的无核小体区域）。 因此，我们可以在不同组织/细...
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ATAC-seq分析：差异分析（10）在下部分中，我们将研究如何使用 R/Bioconductor 识别开放区域中的变化。 在这里，我们将采用类似于 Diffbind 中的方法，并在...
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ATAC-seq分析：Annotating Peaks（9）1. 注释开放区域 将已识别的无核小体区域与基因组特征（如基因和增强子）相关联通常很有趣。 一旦注释到基因或增强子的基因，我们就可以开始将 AT...
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ATAC-seq分析：Peak Calling（8）
1. 寻找开发区域 ATACseq 的一个共同目标是识别转录因子结合和/或转录机制活跃的无核小体区域。该核小体游离信号对应于小于一个核小体的片段...
专题公告
数据分析
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