1.首先安装eggnog-mapper软件 注释所需要的物种数据库网址如下，同时也可以用里面的脚本download_eggnog_data.py...
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构建自己物种的orgDb
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根据自己构建的orgDb进行GO分析1. 在Rstiduo中安装自己的orgDb包 2. 载入R包并大致查看一下R包的内容 可用keys（）命令查看一下这个包大致有哪些genes。...
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RNA-seq(10):KEGG通路可视化:gage和pathview这部分直接从上部分RNA-seq(9):富集分析(功能注释)[https://www.jianshu.com/p/5d82acad6008]的数...
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综合性突变危害性预测软件
基于测序数据得到的候选变异，如何判定突变是否有害呢？准确区分中性突变与致病突变对遗传病的临床检测有着重要的意义，研究表明，对于单个样本的外显子数...
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基因功能富集调控网络分析--FGNetFGNet介绍 FGNet（Functional Gene Networks derived from biological enrichm...
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maSigPro包:时间序列数据处理工具（带图展示）时间序列研究的是基因表达的动态行为，测量的是一系列和时间点之间有强烈相关性的过程。和针对某一时间点的基因表达进行差异分析不同，时间序列更加关注是...
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植物启动子-顺式作用元件-批量提取-预测-可视化分析写在前面 以前总看到问题是，基因结构可视化的问题；现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单，也比较玄乎，所以我一直不是太乐意与别...
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R包SCENIC：分析流程
GRN：基因调控网络 分为四步进行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点; 过滤表达矩阵并运行R包...
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Week 6 转座子-转座重组-分析转座的实验http://mooc.guokr.com/note/19349/ Lecture 11: Mechanism of Transposition...
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解决 Stringtie 基因重复定量的意外收获说明：因为平台限制和平台广告等原因，今后的文章将不在简书更新，请移步并订阅个人博客 说明：因为平台限制和平台广告等原因，今后的文章将不在简书更新...
专题公告
生物遗传调控机制
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